农畜特产品加工专业是学院主干专业之一，也是学院的一个新兴专业。该专业建立在校内的畜产品加工中心、食品化学分析室、食品微生物检验室等实训，建立在校外的广州雨润集团、青海省天露乳业、青海天成大荣公司等实训基地，完全满足专业教学实验、实训、生产实习的需要。目前学院正与青海天成大荣有限公司筹建“天成青牧”畜产品加工基地和理实一体化实训基地，能使学生真正做到“做中学、学中做”，学生毕业后可直接在该公司全部就业。
该专业全面推进“校企合作、工学结合”，探索多元式化的校企合作办学机制，与雨润集团、天露乳业、天成大荣等企业基本实现了“四个合作”（合作办学、合作育人、合作就业、合作发展）。现开设有畜产品化学与分析技术、畜产品微生物、畜产品营养与卫生、畜产品机械与设备、畜产品加工工艺技术、畜产品包装技术、畜产品保鲜技术、乳与乳制品加工技术、肉与肉制品加工技术、蛋与蛋制品加工技术、畜产品卫生检验技术、畜牧兽医概论、畜禽副产品开发利用技术、畜产品市场营销等专业课程。
该专业主要培养适应畜禽产品加工行业生产、管理和服务第一线需要的德、智、体、美、劳等全面发展的高端技术技能型人才，培养的学生具有扎实的专业基础理论知识和从事畜产品生产、加工、营销工作的基本技能，具有良好的职业道德和敬业精神。学生毕业后，可从事企业的生产工艺设计、新产品开发、质量检测、经营管理、科研成果推广、农畜产品质量监督检测等工作，也可在农畜特产品加工行业自主创业。
由于近年来国内许多大型畜产品加企业（乳制品厂、肉制品厂、蛋制品厂等）对本专业的人才需求量越来越大，因此该专业就业前景非常广阔。
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